1. Prawa autorskie do prac dyplomowych.
Prawa autorskie do prac dyplomowych określa Ustawa z dnia 4 lutego 1994 r. o prawie autorskim i prawach pokrewnych (t.j. Dz.U. z 2000 r. nr 80, poz. 904 z późn. zm.), gdzie wymienione są efekty pracy naukowej. Zgodnie z nią prawo do pracy dyplomowej przysługuje autorowi, czyli studentowi, który pracę napisał. Mogą jednak istnieć wyjątki od tej reguły w przypadku, gdy student podpisze oświadczenie przenoszące prawa autorskie. Warto sprawdzić co na temat praw autorskich do prac dyplomowych mówi regulamin studiów uczelni. W przypadku Uniwersytetu Warszawskiego nie ma o prawach autorskich nic (należy więc uznać, że prawa należą do studenta), zaś na Uniwersytecie Mikołaja Kopernika napisano w regulaminie, że prawa autorskie regulują odrębne przepisy (czyli mowa o w/w ustawie), ale uczelnia zobowiązuje studenta do podpisania oświadczenia dającego uczelni prawo do dysponowania pracą do celów naukowo-dydaktycznych. Nadal więc prawo autorskie pozostaje w ręku studenta.
2. Korzystanie z prac zamieszczonych na Magisterium.
Każdy z Użytkowników w czasie rejestracji akceptuje Regulamin, który nakłada na niego obowiązek poszanowania praw autorskich zamieszczonych prac.
System portalu umożliwia monitoring, które prace są pobierane przez Użytkowników.